En un principio se iban a hacer cargo de esta obra los Hermanos de las Escuelas Cristianas (de La Salle) pero no llegaron a un acuerdo con el Patronato.
El 16 de enero de 1950 el Ministerio de Educación Nacional nombra a los Clérigos de San Viator regentes de este Colegio, y el 2 de febrero comienzan las clases con 5 profesores y 250 alumnos. El Director es el H. José Gómez Huidobro. En septiembre se admiten 80 alumnos nuevos y aumenta en 2 la plantilla de profesores, todos religiosos.
El 21 de abril de 1951 se solicita la construcción de un comedor que empezará a funcionar al comienzo del curso 1952-53. También se construye la carpintería para los que quieren aprender un oficio.
En el curso 52-53 se implanta Bachillerato. El 8 de julio de 1953 se inaugura la Biblioteca con 1.500 libros que dona el Ministerio de Educación.
El curso 1953-54 comienza con 500 alumnos. El 14 de mayo de 1954 el Consejo de Ministros celebrado en El Pardo se prueba la Escuela de Aprendices de Ntra. Sra. de Fátima.
En septiembre de 1954 comienzan las obras de nuevo pabellón, entre las calles Manuel Muñoz y Madre Cándida de Jesús. El arquitecto es D. José Manuel Bringas.
En Mayo de 1955 hacen por primera vez en el Colegio nuevo 95 niños la Primera Comunión. Asiste la Marquesa de Oteiro, miembro del Patronato.
El 13 de septiembre de 1955 comienza el nuevo curso con 711 alumnos: 459 en Primaria, 56 en Ingreso a Bachillerato y 196 en los cuatro cursos de Bachillerato Elemental. El día de San Viator, 21 de octubre, se inaugura la Capilla del Colegio.
En el curso 1957-58 comienza el Bachillerato Superior y en el 59-60, el Preuniversitario.
Con la Ley General de Educación de 1970 el Colegio tendrá E.G.B. y F.P.
Con la LOGSE de 1990, desaparece la F.P. y se inicia la Educación Infantil.
Desde el año 2017 nos convertimos en centro Preferente. Actualmente tenemos 2 aulas TGD.
En el año 2021 inauguramos un nuevos edificio que integra las oficinas, despachos y nuevos espacios educativos, entre los que se encuentra un laboratorio y un aula de más de 100 metros cuadrados de usos múltiples.
Actualmente el Colegio tiene las tres etapas obligatorias: Infantil, con 140 alumnos, Primaria, con 280 alumnos y Secundaria (ESO) con 230 alumnos, haciendo un total de 650 alumnos y 52 profesores, de los cuales 2 son religiosos Clérigos de San Viator.